La región estuvo habitada por indígenas guerreros de origen y lengua otomi, dependientes del tlatoanazgo de amóllan y posteriormente de Collíman. En el "cerro de palacio" al sur del pueblo actual, tenían un centro religioso prehispánico.La invación española fue en 1524, por Francisco Cortés de San Buenaventura. Y bajando a los indígenas del cerro los establecieron en "ojo de Agua Pichintota' de donde se cambiaron al sitio actual, en donde la corona española les dioel titulo de pueblo con Antonio de Azelga como alcalde. La región pertenecio a la Provincia de Avalos y en 1786 se anexó a Nueva Galicia.El 7 de mayo de 1824 ya existía el departamento de Txcacuesco. El 14 de noviembre del mismo año se erigío como municipio.
Toxcacuezcómatl

en el granero de Tóxcatl;
tóxcatl=fiesta de la sequía,
cuezcómatl=granero o troje
(representado por: cuezcómatl=granero como olla, tóxcatl=sequedad)