Antiguo poblado de indígenas wirxaritari, coras y zacatecos; cazadores y pescadores que se establecieron al dedicarse a la agricultura; perteneciendo al tlatonazgo de Colótlan.

La conquista española la realizó Pedro Almíndez Chirinos en 1530. Por la hostilidad de los belicosos chichimecas, el virrey Luis de Velazco envío a 100 familias tlaxcaltecas a radicar en Mezquitic, aunque no se mezclaron con los habitantes del lugar.

Perteneció al munhicipio de Huejuquilla el Alto desde el 9 de Noviembre de 1861, y aparece como municipio el 5 de Mayo de 1880.