La fundación se debió a las diferencias entre el tlatoani coca de Poanzítlan y el jefe tecuexe hapalac que, en 1510 se decidieron en buscar un nuevo sitio para establecerse, en un lugar llamado "Los Varales" o "El Varal", o cerca del manantial "Ojo de agua".

Los españoles invadieron la región en 1530, cuando el ejército de Nuño de Guzmán entró en el Valle de Coynán (hoy la barca).

El 27 de marzo de 1824 se erigió como municipio contando con ayuntamiento.

Ixtlahuácan

lugar de llanuras;
ixtláhuatl=llanura,
can=lugar
(representado por: íxtli=cara (ojos), tlálli=tierra, xócotl=arbol frutal membrillo)