Los primeros habitantes fueron los indígenas tecos y cazcanes. En 1510 exploraron el valle los purépechas, y fundaron el pueblo de Coquícuaro. Nuño de Guzmán, a principios de 1530 utilizó el lugar como centro de operaciones. El 4 de julio de 1541, en San Juan del Monte, Cuquío, murió el capitán español Pedro Alvarado, después de la derrota en el Cerro del Miztón, ante los indígenas rebeldes.
En 1844 se estableció el ayuntamiento.